学院选择是游戏初期的重要环节，但实际对游戏玩法的影响较为有限。四大学院分别为格兰芬多（代表火，标志狮子）、赫奇帕奇（代表土，标志獾）、拉文克劳（代表风，标志鹰）和斯莱特林（代表水，标志蛇）。选择学院后，玩家的长袍院徽、宿舍装饰及服装代表色会相应变化，同时好友招募仅限于同学院且同性别成员。主线剧情、魔法课程及核心玩法不会因学院不同而产生显著差异。
学院选择流程分为两个阶段：系统推荐与自主选择。玩家在分院仪式中会先观看一段动画，随后分院帽会根据预设算法推荐一个学院。若对推荐结果不满意，可点击我再想想手动切换查看其他学院简介，最终确认加入心仪学院。需注意，目前游戏未开放转学院功能，若想更换学院只能通过创建新角色重新选择。
从游戏机制角度分析，学院选择对战斗属性无直接影响。例如斯莱特林虽被描述为爆发伤害高，但实际卡牌强度、回响搭配等核心战斗要素与学院无关。部分攻略建议新手选择格兰芬多，因其火系技能搭配相对简单，但这更多是基于操作习惯的推荐，而非数值优势。玩家完全可根据个人偏好或原著情怀选择学院，无需过度纠结实战表现。
社交功能是学院选择需考量的另一因素。同学院玩家可组建寝室、参与学院专属活动并积累学院积分。若希望与现实好友同住，必须确保双方选择相同学院和性别。部分限时活动如学院烟花仅限同院成员协作完成，但这类活动奖励通常为装饰性道具，不影响角色成长进度。
游戏设计上四大学院平衡性较强，未设置隐藏机制或特权差异。建议玩家参考分院测试题结果或直接选择原著中最喜爱的学院，后续通过卡牌收集、回响强化等系统提升战力才是关键。若未来版本更新学院专属玩法，官方通常会提前发布公告说明调整细节。
